农药杀菌剂是目前农业市场较为流行的一种农药品种，不同的杀菌剂产品可以治疗不同的病害，基本可以分为以下四类：
种类一：保护性杀菌剂：该类杀菌剂能够保护未被病菌侵染的施药部位，免受病菌的侵染，需要在作物没有接触到病或病害发生之前喷药才可收到效果。
一般在病害流行前施用于植物可能受害的部位以保护植物免受病害侵染，保护性杀菌剂主要作用方式是在施药后，在植物表面形成一层药膜，使病菌不能被侵染。常见的有波尔多液、石硫合剂、代森锰锌、代森锌等。
种类二：铲除性杀菌剂：该类杀菌剂对病原菌有直接强烈杀伤作用，但在植物生长期植物不能忍受这类药剂，因此只能在播种前用于土壤的处理、植物休眠期或者种苗处理使用。常见的有福尔马林消毒带菌种子，戊唑醇对小麦条锈病、白粉病使用方法得当有铲除作用。
种类三：治疗性杀菌剂：该类杀菌剂也叫内吸性剂，在植物染病以后施用，在药剂被植物吸收传导后，可抑制植株各个部位的病菌发展及杀死病菌。常见的有多菌灵、托布津、春雷霉素、嘧菌酯百菌清等。
种类四：抗病激活剂：该类杀菌剂对植物处理后，通过识别病原菌从而诱导植物全株抗病的物质即为植物的抗病激活剂。但这种药剂不能直接呈现杀菌活性，而是在使用几天后较长时间予以抗病，故不易产生抗性。常见的药剂有草酸、苯并噻二唑、烯丙苯噻唑。
大多时候这些杀菌剂都是可以达到效果的，但是当遇到我们使用生物有机肥料的时候怎么办呢，以及生物防治的时候，我们就需要以菌制菌，达到利用有益菌去除有害菌的方法。一方面我们需要把施用时间分开，不用混用。另一方面我们则需要减少化学杀菌剂的使用量。减少农药的施用才是土地可持续发展的有效保证。
