有机肥料的范围很广，几乎包括除化肥外的所有肥料，其来源十分广泛，品种相当繁多。按有机肥料相同或相似的产生环境或施用条件，类似的性质功能和积制方法大致分为：粪尿肥、堆沤肥、秸杆肥、绿肥、土杂肥、微生物肥料等几大类。
生物有机肥与普通商品有机肥料很难辨别，主要原因是从外形上看，生物有机肥与普通商品有机肥十分相似，普通方法无法区分，而“特定功能”又是看不见摸不着的，那么怎样区分它们呢？
一看包装是否规范
1.包装右上角是否有农业部微生物肥料登记证，证号表示方法为“微生物肥（登记年）临字（编号）号”或者“微生物肥（登记年）准字（编号）号”。
2.包装中上部是否有有效活菌数(cfu)的技术指标，表示方式为“有效活菌数(cfu) ≥？亿/克”，行业标准中规定“≥0.2×亿/克”就合格。如果企业为了迎合市场，刻意把有效活菌数(cfu)标得很高是可以的，但是一定要生产厂家出具在产品有效期内产品有效活菌数(cfu)指标的测定报告。
3.包装背面下部是否有产品有效期规定，行业标准规定大于6个月就可以。因为生物有机肥料中的特殊功能菌种是活的、有生命的，随着产品保存时间的延长，特殊功能菌种的有效活菌数（cfu）会不断减少，所以产品有效期标得太长是对用户不负责的。
二看产品是否均匀
1.生物有机肥料的关键作用是靠“特殊功能的微生物菌种”，产品含水量太高或太低都不利于菌的存活，所以从含水量参考判断比较直接，抓一把肥料在阳光下观察物料是否阴潮、抛起来看看是否起灰尘。
2.前面我们已经讲过，在生物有机肥料中所使用的有机肥载体应该是由多种有机营养物质组成的“套餐”，既然是多种原料组合，在光线下观察就应该能够看到多种原料组成的痕迹。
三看产品是否有效果
生物有机肥料的特殊作用是通过“特殊功能的微生物菌种”体现的，假如产品中没有“特殊功能的微生物菌种”或其含量不高、能力不强是影响使用效果的关键。笔者根据实验室的经验设计了一套简单的方法：
第一步：取少量产品加一点自来水调成面团状，放在冰箱里结成冰块，第二天再在太阳下溶化，这样经过至少三次反复冻溶，肥料中的菌种将会冻死（细胞结冰、形成冰针刺破细胞），数量将会大幅度减少，通过菌种所起的作用就基本消除了。
第二步：将原产品与反复冻溶过的两种肥料、粪便在相同的田块里进行试验比较或者小盆钵试验（用量根据说明），定期观察比较两者差异，如果差异不明显，则说明该生物有机肥产品中的“特殊功能菌种”的能力不强或者数量不够、甚至没有。
注意，在效果试验中，即使我们观察到原产品与反复冻溶过的两种肥料之间田间生长效果很好，但彼此之间差异不明显，也只能理解为厂商为了提高效果在肥料可能添加了一些促进生长物质，而不是功能微生物菌种的作用，这种肥料作用效果有限，不能作为生物有机肥。
