发展历史
我国微生物的生产始于20世纪50年代，至今有50余年历史。经历4个发展阶段。
1、第一阶段为20世纪50年代初期
当时生产的产品以根瘤菌接种剂为主，如大豆、花生、紫云英根瘤菌剂，应用面积不大。
2、第二阶段为20世纪50年代末期
当时生产的产品除根瘤菌接种剂以外，还有其他细菌和放线菌剂，如自生固氮菌剂、解磷（巨大芽孢）细菌制剂、5406放线菌剂等。生产管理落后，持续时间短。
3、第三阶段为20世纪60-70年代
生产仍以土法生产，群众运动为主。产品各类不少，但质量不高，维持时间不长。
4、第四阶段为20世纪80年代至今
其间发展经历无序发展、有序发展和创意发展3个时期。实际上从无标准、无行业管理、市场混乱和宣
传夸大，甚至误导、欺诈。农业部于1994正式颁布了第一个微生物肥料标准，1996年正式将微生物肥料纳入生产资料登记管理。产品品种发展较快，质量逐步提高，应用效果逐步得到农民认可。
目前现状
现在农业生产上除了有机肥和化肥以外，市场上还有一类微生物肥料。微生物肥料也叫菌肥。它是将自然界固氮菌、解磷菌和解钾菌复合在一起，经过特殊工艺、科学配方、组合加工而成的一种无公害、具有一定活菌数的复合生物肥。
从概念里应该大家也发现了，所谓的微生物肥料，就是由微生物菌种构成，本身是不含氮、磷、钾等养分的，但是它们通过所含菌种的一系列活动可以起到固定空气中的氮素，分解土壤中有机态的磷、钾养分，供给作物吸收利的作用。这就让生物肥料在目前农业生产中也占有一定的位置。
早期的生物肥料叫细菌肥料。相当于现在我们说的微生物菌剂，就是一种纯生物制剂，不加任何化肥和有机肥料。如固氮的根瘤菌剂，解磷的磷菌剂和解钾的硅酸盐菌肥等，现在我们说的微生物肥料除了具有复合菌的功能外，通常还会与有机肥或化肥复配。这样的微生物肥料，依然是一种辅助性肥料，产品中的微生物作用不可忽视，还应具有生物菌剂与养分的双重综合。只有这个的微生物肥料才是值得施用的肥料。
所以在对待微生物肥料的时候应该要正确的去选择，不要盲目的采用，也不可盲目的排斥。这类产品的选择还是应以作物生长环境去进行综合考虑。例如，我们的土壤中含氮量本身已足够高，就无需利用生物固氮增加作物的氮元素吸收。还比如，土壤中如果本身磷含量就不足，那么我们利用生物解磷也是达不到磷元素提高的目的的。
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